根据学校中医药类专业为主体，医、管、文、理、法等专业协调发展的原则，在保证中医学、中药学专业主体地位的基础上，根据社会发展需要，积极发展与中医药事业发展及健康产业密切相关的其他专业，使学校专业结构更加科学合理。学校现设有中医学、中药学、中药制药、药学、针灸推拿学、康复治疗学、公共事业管理、药事管理、信息管理与信息系统、护理学、英语、法学12个本科专业，涵盖医学、理学、文学、管理学、法学5大学科门类。
1988年，在只有中医学专业五年制、不能满足高层次人才培养需求的情况下，学校在专家研究论证基础上，先后3次提请设置七年制;1991年，经国家教委批准，正式举办中醫学专业七年制，首批招生20人，开始探索中医拔尖人才内涵与培养模式，并不断丰富完善;在总结20年拔尖人才培养的基础上，顺应时代需求，2011年，首创中医学专业9年制（岐黄国医班），攀教改高峰;2012年，率先开办中医学“5+3”一体化，为国家奏响医教协同序曲。在长期的办学实践中，学校凝练总结了一系列教育教学思想。首创中医“院校—师承—家传”教育相结合模式，最早提出“早临床、多临床、反复临床”中医临床教学理念，提出并实施“厚基础、宽口径”的人才培养方式，提出并践行“读经典、做临床、跟名师、悟妙道”的中医人才成长模式，建立健全“五维一体，一以贯通，多途径培养”的中医拔尖创新人才培养模式。
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