生物类专业英语实践性教学的思考

时间:2022-12-01 16:10:11 浏览量:

摘要:生物类专业是一门实践性强的专业,其专业英语教学也同时应具备较强的实用性。本文以生物类专业分子生物学内容为例子,提出了专业英语的实践性教学思路,包括阅读专业英文文献、使用专业软件、阅读实验工具的说明书、专业网站的解析等方面,以期提高学生运用专业类英语的能力。

关键词:生物;专业英语;实践性教学

中图分类号:G642.0?摇 文献标志码:A 文章编号:1674-9324(2013)25-0070-02

生物类专业英语课是面向生物科学和生物技术专业高年级本科生开设的必修课程,其先修课为大学英语及一些专业基础课程,教学目标为拓宽学生专业词汇量,帮助提高学生阅读专业英语的能力,熟练使用一些英文版本的专业工具,为专业科技论文的书写打下良好的基础。但是,该课程很容易停留在生物科普英语文章的阅读上,从而成为大学英语教学的简单延伸。笔者认为,生物类专业英语的教学应该加强其实践性,其上课方式应有机地结合专业课和英语课的教授方式,使学生不仅掌握专业英语词汇,并且能够对已经学习过的专业基础课进行有效的复习及进一步的加深理解,而且能够基本掌握英文版本的专业工具。分子生物学是生命科学发展过程中产生的对生物在分子层次上进行研究的一门课程,其研究领域涵盖了遗传学、生物化学和生物物理系等学科,是生物科学和生物技术专业本科生非常重要的专业基础课,同时也是一门理论性和实践性紧密结合的课程。

本文以分子生物学的内容作为例子,来探讨生物类专业英语教学的一些思路,以期对生物类专业英语的教学改革起到抛砖引玉的作用。该部分教学内容可包含以下几个部分。

一、英文说明书的阅读

一般说明书内容包括最基本的产物概况、性能、特点、使用方法和保存等。在分子生物学实验中,最基本的实验操作有质粒提取、各类酶的使用、PCR操作等。通过对说明书的阅读,学生不仅能熟悉这些试剂、药品的英文单词,而且能够对以前学过的专业知识加以熟悉。比如在酶切反应实验中,主要的工具是限制性内切酶,很多学生做该类实验的时候,都是请教老生,或者直接依赖于某些现成的操作步骤。一般情况下没有太多问题,但是如果某些酶比较特殊,有特殊的反应温度或具有星活性,不仔细钻研说明书的话,就很容易出错。还有些学生对酶的保存或适用缓冲液也比较糊涂。利用专业英语课,对限制性内切酶的说明书进行阅读,学生可以对限制性内切酶有系统的了解,包括浓度、纯度、使用方式、贮存液等英文描述,而且养成学生做实验前仔细阅读特定酶说明书的习惯。例如,在NEB(New England Biolabs)出产的BamHI核酸内切酶说明书里,包括四大部分的内容:一是产品的基本信息,比如酶量、浓度、生产批号、贮存条件、保质期、识别序列等;二是产品包装的说明,其中有购买该酶附带在反应中共同使用的试剂(Reagents Supplied with Enzyme),反应条件(Reaction Conditions)及附带试剂中缓冲液的组成(1X NEBuffer 3),酶单位定义(Unit Definition)以及稀释兼容性(Diluent Compatibility);三是产品质量控制检测(Quality Control Assays),说明该酶出厂前有以下几种质量控制检测方式,分别是Ligation、16-Hour Incubation、Exonuclease Activity、Endonuclease Activity和Blue/White Screening Assay,并对每种检测方式进行描述;四是酶的特性(Enzyme Properties),包括在不同缓冲液中的活性(Activity in NEBuffers)、酶活性持续时间(Survival in a Reaction)、是否加热失活(Heat Inactivation)以及对质粒的切割时间及用量(Plasmid Cleavage)。这些方面的内容在一般教科书里都没有,但是学生又是在使用该酶时必须要掌握的知识,不仅是简单的英文翻译,并且其专业内涵也要清楚。

二、文献摘要的阅读

文献摘要是科技论文的精华,是简明扼要呈现文献主要内容的一种方式,能使读者在最短的时间内得知原著的大意。这也是生物学家在寻找研究思路,确定研究方法之前最大量阅读的文献类型。尽量选择学生在专业课中已经学习过的,同时也是分子生物学课程中的重点内容,比如核酸结构和功能、蛋白质结构和功能、分子生物学研究技术等的相关文献。文献主要有两大类,一类是综述文献,是在大量研究论文的基础上进行归纳、提炼出来的针对某一专题的文章;另一类是实验研究论文,是指通过实验对某些科学问题进行研究,最后通过结果得出结论的一些文章。例,发表在2009年Nature上的“On the road to reading the RNA-interference code”就是一篇综述文献,其摘要为:The finding that sequence-specific gene silencing occurs in response to the presence of double-stranded RNAs has had an enormous impact on biology,uncovering an unsuspected level of regulation of gene expression.This process,known as RNA interferenc(RNAi)or RNA silencing,involves small non-coding RNAs,which associate with nuclease-containing regulatory complexes and then pair with complementary messenger RNA targets,thereby preventing the expression of these mRNAs.Remarkable progress has been made towards understanding the underlying mechanisms of RNAi,raising the prospect of deciphering the "RNAi code" that,like transcription factors,allows the fine-tuning and networking of complex suites of gene activity,thereby specifying cellular physiology and development.该摘要简洁地介绍了RNAi技术的意义及基本过程,然后提出了在对RNAi深入研究的基础上,可通过破译RNAi密码来对基因进行更为精确的调节,以调控细胞的生长发育。通过阅读这篇简短的摘要,学生可以了解RNA沉默的两种表述方式“RNA interference”和“RNA silencing”,以及RNAi过程,即通过非编码小RNA与具有酶活性的调节复合体共同作用于互补与小RNA的信息RNA的靶序列,抑制其表达。在讲解的过程中,还可以让学生回顾RNA的分类及不同RNA的功能,并且将几种RNA的英文表述进行复习。

三、专业软件的使用

在分子生物学序列分析中,有不少常用的免费软件都是英文界面的,如ApE可以对基因序列进行各种操作,将序列从环形转换为线形,还可以转换为互补序列,并且可以对序列进行酶切位点分析,简单的质粒酶切图谱绘制,酶切片段大小分析,开放阅读框架查找,核酸序列到氨基酸序列的转换及蛋白质片段分子量计算,引物设计,不同序列同源性比对,这些功能能满足基本的分子生物学核酸序列分析,界面简单。在讲授方式上,可以给出一些DNA序列,选定一些限制性内切酶,让学生直接用该软件分析酶切后的片段的预计大小,或者对一些同源序列进行比对等。

四、专业网站的解析

学生应该学会使用公共平台上的一些专业网站,如美国国家生物技术信息中心NCBI,具有强大的数据库检索系统,能进行基因序列分析、染色体分析、基因组规模分析、基因表达及分型分析、蛋白质结构及建模分析,为全世界生物学家所最为常用的专业网站。针对生物科学和生物技术专业的大学生,可采用其相对比较简单的功能入手,比如进行文献的Pubmed及一些核酸序列的同源序列搜索功能。在讲授方式上,文献检索可给出学生在专业课和专业基础课中学过的一些知识的英文单词,如让学生去进行检索,其检索内容尽量具体,比如酵母双杂交(yeast two hybrid),输入英文单词后,就会显示出很多文献,这些文献都按时间发表的先后顺序进行排列,最新的排在最前,因为该技术已经被发明了很多年,所以前面大多文献都只是使用了该技术,如果想深入了解其原理,可以在右方的“related searches”中点击“yeast two hybrid system review”,这类综述文章就会更深入地讨论该技术的发明、发展及应用。通过文献检索,不仅让学生熟悉该网站的功能,培养进行英文检索的习惯,并且能开拓他们的视野,让他们知道新的研究成果每天都在层出不穷。

这几方面的内容可以有机地联系在一起。比如,先给学生一些需要查找文献的关键词,然后从搜索出来的文献中找出部分来让学生进行摘要阅读;或者给出一段DNA序列,让学生在NCBI数据库中进行搜索,看看是什么样的基因,并用ApE软件进行酶切位点分析,编码的蛋白质序列分析,再选定其中的酶切位点,让学生阅读该内切酶的说明书,甚至可以延伸到怎么样对该基因进行克隆。

综上所述,笔者认为,生物类专业英语的教授方法应该紧扣专业知识,让学生学习及掌握英文这门工具对专业知识的拓展和专业技术的使用,从而具有更强的实用性。

参考文献:

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[3]王哲,黄高升.NCBI的数据库资源及其应用[J].生命科学,2002,14(1):59-62.

[4]Siomi H,Siomi MC.On the road to reading the RNA-interference code[J].Nature,2009,(1),457(7228):396-404.

作者简介:费小雯(1973-),女,四川洪雅人,博士,海南医学院理学院生物化学与分子生物学教研室副教授。

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